Kubo hipnotizează oamenii din satul său cu darul său magic de a învârti povești sălbatice cu origami. Când invocă accidental un spirit rău care caută răzbunare, Kubo este forțat să meargă într-o căutare pentru a rezolva misterul tatălui său samurai căzut și a armelor sale mistice, precum și pentru a-și descoperi propriile puteri magice.